Separateの発音・読み方は2つあります。
動詞の場合は、
SEP-uh-reyt 音声を聞く
1番目の音声の読み方です。
This contest will separate the men from the boys.
形容詞が動詞の場合は、
SEP-er-it 音声を聞く
2番目の音声の読み方です。
Those two products are from two separate companies.
この読み方の注意点は、終わりの発音です。
「ate」は「it」の読み方です。
アメリカ英語の発音の勉強にこのテキスト・Mastering the American Accentをお勧めです。私もクラスで使っています。